Modelo de interaccion entre quercetina (3,5,7,3p,4p-pentahidroxiflavona) y factor de choque térmico (HFS) humano

Contenido principal del artículo

Autores

Diana Carolina Clavijo B.
Juvenal Yosa R.
Orlando Acevedo S.
Claudia Cifuentes
Carlos M Estévez Bretón

Resumen

INTRODUCCIÓN. La expresión de las proteinas de choque térmico (HSP) inducibles por estrés esta regulada por el factor de choque térmico (HSF), el cual existe en forma inactiva monomérica y que al trimerizarse es capaz de unirse al DNA activando la transcripciónde las HSP.

OBJETIVO. Diseñar un un modelo computacional que contribuya a elucidar las posibles interacciones entre el fl avonoide quercetina y proteínas como el HSF-1.

METODOLOGÍA. Para observar cómo la quercetina afecta posiblemente la trimerización de la HSF se realizó el modelo por homología de humano del factor de shock térmico (HSF-1), obteniendo un modelo con alta homología estructural con la misma proteína de Kluyveromyces lactis, este modelo fue usado para realizar docking con el fl avonoide quercetina (3,5,7,3p,4p-pentahidroxifl avona).

RESULTADO Y CONCLUSIÓN. El resultado del docking mostró que la quercetina se une a un loop (“ala”), que es de importancia para la interacción entre proteína-proteína, probablemente afectando la trimerización de esta..

Palabras clave:

Detalles del artículo

Licencia

Derechos de autor 2017 Diana Carolina Clavijo B.

Política de acceso abierto

Esta revista proporciona un acceso abierto a su contenido, teniendo en cuenta el principio de que ofrecer al público un acceso libre a las investigaciones ayuda a un mayor intercambio global del conocimiento y no se hace responsable de los contenidos publicados.

Consideraciones éticas 

En sus publicaciones la REC contempla las políticas relacionadas con aspectos éticos que se encuentran en World Associationof Medical Editors (WAME)(http://www.wame.org/about/recommendations-on-publication-ethics-policie)

Política sobre derechos de autor

Los autores que publican en la revista se acogen al código de licencia creative commons 4.0 de atribución no comercial sin derivados y compartir igual.

Referencias

Jaattela M.. Escaping cell death: survival proteins in cancer. Exp.Cell Res. 1999;248(1):30–43.

Jaattela M.. Over-expression of hsp70 confers tumorigenicity to mouse fi brosarcoma cells. Int. J. Cancer. 1995;60(5):689–693.

Garrido C., Fromentin A., Bonnotte B., Favre N., Moutet M.,Arrigo A.P., et al. Heat shock protein 27 enhances the tumorigenicity of immunogenic rat colon carcinoma cell clones. Cancer Res.1998;58(23):5495–5499.

Jaattela M., Wissing D., Kokholm K., Kallunki T., Egeblad M.Hsp70 exerts its anti-apoptotic function downstream of caspase-3-like proteases. EMBO J. 1998;17(21): 6124–6134.

Gurbuxani S., Bruey J.M., Fromentin A., Larmonier N., Parcellier A., Jaattela M., et al. Selective depletion of inducible HSP70 enhances immunogenicity of rat colon cancer cells. Oncogene. 2001;20(51):7478–7485.

Hosokava N., Hirayoshi K., Nakai A., Hosokava Y., Marui I., Yoshida M., et al. Flavonoids inhibit the expression of heat shock proteins. Cell Struct. Funct. 1990;15(6):393–401.

Hansen R. K., Oesterreich S., Lemieux P., Sarge K. D., S. Fuqua A. W. Quercetin Inhibits Heat Shock Protein Induction but Not Heat Shock Factor DNA-Binding in Human Breast Carcinoma Cells. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1997;239(3):851–856 .

Kleywegt, G.J. Crystallographic refi nement of ligand complexes. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 2007;63(Pt 1):94-100.

Kleywegt, G.J., Henrick, K., Dodson, E.J., Van Aalten, D.M.F.Pound-wise but penny-foolish - How well do micromolecules fare in macromolecular refi nement ?. Structure. 2003;11(9):1051-1059.

Kleywegt, G.J. and Jones, T.A. Databases in protein crystallography.Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 1998;54(Pt 6 Pt 1):1119-1131.

Humphrey, W., Dalke, A. and Schulten, K. “VMD - Visual Molecular Dynamics”.J Mol Graph. 1996;14(1):33-38, 27-28.

Visual Molecular Dynamics [internet]. Illinois: University of Illinois at Urban Champaign; c2006. [Consultado 2010 oct 15]. Disponible en: http://www.ks.uiuc.edu/Research/vmd/

Schmidt M.W., Baldridge K.K., Boatz J.A., Elbert S.T., Gordon M.S., Jensen J.H., et al. “General Atomic and Molecular Electronic Structure System. J. Comput.Chem. 1993;14(11):1347-1363.

Gordon M.S., Schmidt M.W. Advances in electronic structure theory: GAMESS a decade later. En: Dykstra C.E., Frenking G.,Kim K.S., Scuseria G.E. Theory and Applications of Computational Chemistry, the fi rst forty years. Amsterdam: Elsevier; 2005. p.1167-1189.

General Atomic and Molecular Electronic Structure System (GAMESS)[internet]. Iowa: Iowa State University; c2007. [Consultado 2008 oct 12]. Disponible en: http://www.msg.ameslab.gov/GAMESS/GAMESS.html

Marchler-Bauer A, Anderson JB, Derbyshire MK, DeWeese-Scott C, Gonzales NR, Gwadz M, et al. CDD: a conserved domain database for interactive domain family analysis. Nucleic Acids Res.2007;35(Database issue):D237-240.FIGURA 7. Docking de la Quercetina con el modelo de HFS humano. En Rojo la quercetina en verde los residuos con los cuales tiene interacción.Fuente: Autores FIGURA 8. Detalle del docking de la quercetina con los residuos con los que interactúa. La nomenclatura corresponde a la del segmento de interacción con HFS humana. Fuente: Autores Modelo de interaccion entre quercetina Clavijo B. y cols. 79

Chemical Computing Group [internet]. Montreal, Quebec, Canada:Chemical Computing Gropu; c1994. [Consultado 2007 oct 10]. Disponible en: http://www.chemcomp.com/

Thomsen R., Christensen M.H. MolDock: A New Technique for High-Accuracy Molecular Docking. J Med Chem.2006;49(11):3315-3321.

Halgren T. A. Merck Molecular Force Field. I. Basis, Form,Scope,Parameterization and Performance of MMFF94. J. Comp.Chem.1996;17(5&6):490-519.

Littelfi eld, O; Nelson, H.C.M.. A new use for the “wing” of the “winged” helix-turn-helix motif in the HSF-DNA cocrystal. Nature Structulal Biology. 1999;6(5):464-470.

Descargas

La descarga de datos todavía no está disponible.